Die Bukui-Moschee gehört zur langen Geschichte der muslimischen Gemeinde Qiqihars. Ein regionalhistorischer Eintrag der Provinz datiert eine frühe Moschee auf 1684, noch vor der Gründung der befestigten Stadt. Ihr erhaltener religiöser Gebäudekomplex gibt dieser frühen Siedlungsgeschichte bis heute einen Ort in der Stadt.
Ein Ortsverzeichnis von 1684 verzeichnet eine kleine Moschee nahe dem Dorf Bukui. Die heutige Schutzgrenze der Provinz umfasst ihren Hof und einen Streifen von 15 Metern jenseits der Mauer.