Экологический охраняемый район Котая находится у моста Лотоса и занимает 55 гектаров. Он разделён на две зоны с разными условиями доступа. Зона 1 площадью около 15 гектаров расположена у северной стороны моста и открывается лишь ограниченно. Зона 2 площадью около 40 гектаров находится на западной стороне намывной территории Котая и управляется с открытым доступом публики.
Эти границы отделяют заповедник Котая от водно-болотных угодий в других местах островов. В частности, водно-болотная территория у домов Тайпы — отдельный участок на Тайпе, и её нельзя считать частью заповедника Котая. На мысленной карте посетителя названия могут казаться близкими, однако охраняемые зоны имеют разные местоположения и режимы управления.